Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CHRNA7P36544 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms