Protein–RNA interactions for Protein: P36012

CSE4, Histone H3-like centromeric protein CSE4, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4P36012 MTM1YGR257C 1101 nt5.64□□□□□ -1.51
CSE4P36012 VMA10YHR039C-A 345 nt5.64□□□□□ -1.51
CSE4P36012 DPH1YIL103W 1278 nt5.64□□□□□ -1.51
CSE4P36012 COQ5YML110C 924 nt5.64□□□□□ -1.51
CSE4P36012 YOR282WYOR282W 321 nt5.64□□□□□ -1.51
CSE4P36012 AIM14YGL160W 1713 nt5.64□□□□□ -1.51
CSE4P36012 GYP6YJL044C 1377 nt5.64□□□□□ -1.51
CSE4P36012 GCR1YPL075W 2358 nt5.64□□□□□ -1.51
CSE4P36012 PAM1YDR251W 2493 nt5.64□□□□□ -1.51
CSE4P36012 YMR221CYMR221C 1515 nt5.64□□□□□ -1.51
CSE4P36012 MNN4YKL201C 3537 nt5.63□□□□□ -1.51
CSE4P36012 KRS1YDR037W 1776 nt5.63□□□□□ -1.51
CSE4P36012 RDN58-1RDN58-1 158 nt5.63□□□□□ -1.51
CSE4P36012 RDN58-2RDN58-2 158 nt5.63□□□□□ -1.51
CSE4P36012 YMR141CYMR141C 309 nt5.63□□□□□ -1.51
CSE4P36012 SIW14YNL032W 846 nt5.63□□□□□ -1.51
CSE4P36012 RIO2YNL207W 1278 nt5.63□□□□□ -1.51
CSE4P36012 YNL276CYNL276C 396 nt5.63□□□□□ -1.51
CSE4P36012 COQ10YOL008W 624 nt5.63□□□□□ -1.51
CSE4P36012 YPL107WYPL107W 747 nt5.63□□□□□ -1.51
CSE4P36012 PHO87YCR037C 2772 nt5.63□□□□□ -1.51
CSE4P36012 STE20YHL007C 2820 nt5.63□□□□□ -1.51
CSE4P36012 RPN3YER021W 1572 nt5.63□□□□□ -1.51
CSE4P36012 AEP1YMR064W 1557 nt5.63□□□□□ -1.51
CSE4P36012 HFD1YMR110C 1599 nt5.63□□□□□ -1.51
CSE4P36012 AKL1YBR059C 3327 nt5.63□□□□□ -1.51
CSE4P36012 CST6YIL036W 1764 nt5.62□□□□□ -1.51
CSE4P36012 VPS27YNR006W 1869 nt5.62□□□□□ -1.51
CSE4P36012 KEX1YGL203C 2190 nt5.62□□□□□ -1.51
CSE4P36012 SEC53YFL045C 765 nt5.62□□□□□ -1.51
CSE4P36012 SUP56tL(CAA)A 82 nt5.62□□□□□ -1.51
CSE4P36012 SUP53tL(CAA)C 82 nt5.62□□□□□ -1.51
CSE4P36012 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt5.62□□□□□ -1.51
CSE4P36012 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt5.62□□□□□ -1.51
CSE4P36012 SUP54tL(CAA)G2 82 nt5.62□□□□□ -1.51
CSE4P36012 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt5.62□□□□□ -1.51
CSE4P36012 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt5.62□□□□□ -1.51
CSE4P36012 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt5.62□□□□□ -1.51
CSE4P36012 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt5.62□□□□□ -1.51
CSE4P36012 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt5.62□□□□□ -1.51
CSE4P36012 VPS63YLR261C 327 nt5.62□□□□□ -1.51
CSE4P36012 CGI121YML036W 546 nt5.62□□□□□ -1.51
CSE4P36012 SHG1YBR258C 429 nt5.62□□□□□ -1.51
CSE4P36012 OST1YJL002C 1431 nt5.62□□□□□ -1.51
CSE4P36012 MSL5YLR116W 1431 nt5.62□□□□□ -1.51
CSE4P36012 GCD10YNL062C 1437 nt5.62□□□□□ -1.51
CSE4P36012 KCC4YCL024W 3114 nt5.62□□□□□ -1.51
CSE4P36012 YEL020CYEL020C 1683 nt5.61□□□□□ -1.51
CSE4P36012 PMI40YER003C 1290 nt5.61□□□□□ -1.51
CSE4P36012 HOP2YGL033W 657 nt5.61□□□□□ -1.51
CSE4P36012 YGL039WYGL039W 1047 nt5.61□□□□□ -1.51
CSE4P36012 CFD1YIL003W 882 nt5.61□□□□□ -1.51
CSE4P36012 MAM33YIL070C 801 nt5.61□□□□□ -1.51
CSE4P36012 MPS3YJL019W 2049 nt5.61□□□□□ -1.51
CSE4P36012 YJL169WYJL169W 369 nt5.61□□□□□ -1.51
CSE4P36012 DAL5YJR152W 1632 nt5.61□□□□□ -1.51
CSE4P36012 UTP11YKL099C 753 nt5.61□□□□□ -1.51
CSE4P36012 YNL043CYNL043C 321 nt5.61□□□□□ -1.51
CSE4P36012 YOR225WYOR225W 330 nt5.61□□□□□ -1.51
CSE4P36012 HAA1YPR008W 2085 nt5.61□□□□□ -1.51
CSE4P36012 BUD6YLR319C 2367 nt5.6□□□□□ -1.51
CSE4P36012 SEC2YNL272C 2280 nt5.6□□□□□ -1.51
CSE4P36012 PAN1YIR006C 4443 nt5.6□□□□□ -1.51
CSE4P36012 YDL228CYDL228C 642 nt5.6□□□□□ -1.51
CSE4P36012 LIF1YGL090W 1266 nt5.6□□□□□ -1.51
CSE4P36012 RGI2YIL057C 495 nt5.6□□□□□ -1.51
CSE4P36012 ABM1YJR108W 372 nt5.6□□□□□ -1.51
CSE4P36012 MCM22YJR135C 720 nt5.6□□□□□ -1.51
CSE4P36012 PDP3YLR455W 915 nt5.6□□□□□ -1.51
CSE4P36012 BSC3YLR465C 309 nt5.6□□□□□ -1.51
CSE4P36012 HRK1YOR267C 2280 nt5.6□□□□□ -1.51
CSE4P36012 JHD2YJR119C 2187 nt5.6□□□□□ -1.51
CSE4P36012 YOR022CYOR022C 2148 nt5.6□□□□□ -1.51
CSE4P36012 ACK1YDL203C 1872 nt5.6□□□□□ -1.51
CSE4P36012 UBP6YFR010W 1500 nt5.59□□□□□ -1.51
CSE4P36012 BCP1YDR361C 852 nt5.59□□□□□ -1.51
CSE4P36012 SLD5YDR489W 885 nt5.59□□□□□ -1.51
CSE4P36012 GPP2YER062C 753 nt5.59□□□□□ -1.51
CSE4P36012 RMR1YGL250W 726 nt5.59□□□□□ -1.51
CSE4P36012 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt5.59□□□□□ -1.51
CSE4P36012 YAL065CYAL065C 387 nt5.59□□□□□ -1.51
CSE4P36012 ARG80YMR042W 534 nt5.59□□□□□ -1.51
CSE4P36012 YOR131CYOR131C 657 nt5.59□□□□□ -1.51
CSE4P36012 ROX1YPR065W 1107 nt5.59□□□□□ -1.51
CSE4P36012 YPR174CYPR174C 666 nt5.59□□□□□ -1.51
CSE4P36012 APL6YGR261C 2430 nt5.59□□□□□ -1.51
CSE4P36012 DSN1YIR010W 1731 nt5.59□□□□□ -1.51
CSE4P36012 BCH2YKR027W 2298 nt5.59□□□□□ -1.51
CSE4P36012 CRT10YOL063C 2874 nt5.58□□□□□ -1.52
CSE4P36012 SWC3YAL011W 1878 nt5.58□□□□□ -1.52
CSE4P36012 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt5.58□□□□□ -1.52
CSE4P36012 YER190C-BYER190C-B 483 nt5.58□□□□□ -1.52
CSE4P36012 YFL068WYFL068W 483 nt5.58□□□□□ -1.52
CSE4P36012 ERV1YGR029W 570 nt5.58□□□□□ -1.52
CSE4P36012 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt5.58□□□□□ -1.52
CSE4P36012 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt5.58□□□□□ -1.52
CSE4P36012 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt5.58□□□□□ -1.52
CSE4P36012 YKL069WYKL069W 543 nt5.58□□□□□ -1.52
CSE4P36012 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt5.58□□□□□ -1.52
CSE4P36012 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.7 ms