Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms