Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP6P35125 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP6P35125 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
USP6P35125 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP6P35125 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP6P35125 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP6P35125 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP6P35125 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP6P35125 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP6P35125 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP6P35125 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP6P35125 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP6P35125 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP6P35125 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP6P35125 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP6P35125 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP6P35125 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP6P35125 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP6P35125 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP6P35125 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP6P35125 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP6P35125 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP6P35125 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP6P35125 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
USP6P35125 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP6P35125 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP6P35125 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP6P35125 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP6P35125 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
USP6P35125 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP6P35125 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP6P35125 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP6P35125 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP6P35125 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP6P35125 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
USP6P35125 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP6P35125 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP6P35125 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP6P35125 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP6P35125 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP6P35125 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP6P35125 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP6P35125 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP6P35125 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP6P35125 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP6P35125 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP6P35125 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP6P35125 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP6P35125 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP6P35125 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
USP6P35125 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP6P35125 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP6P35125 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP6P35125 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP6P35125 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP6P35125 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
USP6P35125 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP6P35125 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
USP6P35125 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP6P35125 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP6P35125 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP6P35125 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP6P35125 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP6P35125 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
USP6P35125 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP6P35125 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP6P35125 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
USP6P35125 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP6P35125 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP6P35125 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP6P35125 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP6P35125 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP6P35125 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP6P35125 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP6P35125 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
USP6P35125 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP6P35125 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP6P35125 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP6P35125 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP6P35125 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP6P35125 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
USP6P35125 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP6P35125 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP6P35125 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP6P35125 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP6P35125 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
USP6P35125 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP6P35125 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP6P35125 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP6P35125 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP6P35125 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP6P35125 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP6P35125 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP6P35125 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP6P35125 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP6P35125 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP6P35125 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP6P35125 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP6P35125 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP6P35125 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms