Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ABCC1P33527 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms