Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH5P33151 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH5P33151 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH5P33151 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH5P33151 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH5P33151 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH5P33151 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH5P33151 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH5P33151 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH5P33151 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH5P33151 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH5P33151 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH5P33151 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH5P33151 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH5P33151 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH5P33151 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH5P33151 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH5P33151 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH5P33151 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH5P33151 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH5P33151 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH5P33151 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH5P33151 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH5P33151 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH5P33151 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH5P33151 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH5P33151 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH5P33151 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH5P33151 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH5P33151 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH5P33151 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH5P33151 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH5P33151 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH5P33151 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH5P33151 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH5P33151 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH5P33151 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH5P33151 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH5P33151 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH5P33151 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH5P33151 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH5P33151 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH5P33151 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH5P33151 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH5P33151 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH5P33151 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH5P33151 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH5P33151 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH5P33151 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH5P33151 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH5P33151 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH5P33151 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH5P33151 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH5P33151 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH5P33151 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH5P33151 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH5P33151 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH5P33151 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH5P33151 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH5P33151 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDH5P33151 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDH5P33151 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDH5P33151 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH5P33151 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH5P33151 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH5P33151 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH5P33151 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH5P33151 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH5P33151 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH5P33151 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH5P33151 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH5P33151 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH5P33151 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH5P33151 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH5P33151 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH5P33151 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms