Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA7P31268 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms