Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
KDM5AP29375 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KDM5AP29375 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms