Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms