Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DMAP28067 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms