Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIAP25963 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIAP25963 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIAP25963 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIAP25963 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIAP25963 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIAP25963 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIAP25963 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIAP25963 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIAP25963 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIAP25963 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIAP25963 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIAP25963 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIAP25963 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIAP25963 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIAP25963 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIAP25963 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIAP25963 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIAP25963 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIAP25963 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIAP25963 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIAP25963 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIAP25963 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIAP25963 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIAP25963 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIAP25963 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFKBIAP25963 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKBIAP25963 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFKBIAP25963 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFKBIAP25963 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFKBIAP25963 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFKBIAP25963 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFKBIAP25963 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFKBIAP25963 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFKBIAP25963 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NFKBIAP25963 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFKBIAP25963 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFKBIAP25963 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFKBIAP25963 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms