Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCP2P22307 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCP2P22307 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCP2P22307 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCP2P22307 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCP2P22307 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCP2P22307 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCP2P22307 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCP2P22307 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCP2P22307 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCP2P22307 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCP2P22307 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCP2P22307 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCP2P22307 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2P22307 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2P22307 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2P22307 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2P22307 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2P22307 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2P22307 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2P22307 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2P22307 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2P22307 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2P22307 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2P22307 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2P22307 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2P22307 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2P22307 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2P22307 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2P22307 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2P22307 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2P22307 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2P22307 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2P22307 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCP2P22307 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCP2P22307 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCP2P22307 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCP2P22307 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCP2P22307 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCP2P22307 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCP2P22307 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCP2P22307 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCP2P22307 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCP2P22307 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCP2P22307 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCP2P22307 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCP2P22307 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCP2P22307 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCP2P22307 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCP2P22307 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCP2P22307 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCP2P22307 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCP2P22307 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCP2P22307 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCP2P22307 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCP2P22307 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCP2P22307 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCP2P22307 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCP2P22307 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCP2P22307 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCP2P22307 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCP2P22307 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCP2P22307 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCP2P22307 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCP2P22307 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCP2P22307 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCP2P22307 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCP2P22307 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCP2P22307 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCP2P22307 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCP2P22307 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCP2P22307 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCP2P22307 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCP2P22307 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCP2P22307 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCP2P22307 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCP2P22307 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCP2P22307 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCP2P22307 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCP2P22307 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCP2P22307 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCP2P22307 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCP2P22307 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCP2P22307 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCP2P22307 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCP2P22307 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCP2P22307 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCP2P22307 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCP2P22307 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCP2P22307 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCP2P22307 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCP2P22307 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCP2P22307 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCP2P22307 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCP2P22307 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCP2P22307 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCP2P22307 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCP2P22307 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCP2P22307 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCP2P22307 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms