Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EPHA1P21709 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms