Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP4AP20648 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms