Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
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