Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GM2AP17900 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GM2AP17900 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GM2AP17900 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GM2AP17900 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GM2AP17900 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GM2AP17900 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GM2AP17900 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GM2AP17900 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GM2AP17900 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GM2AP17900 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GM2AP17900 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GM2AP17900 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GM2AP17900 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GM2AP17900 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GM2AP17900 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GM2AP17900 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GM2AP17900 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GM2AP17900 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GM2AP17900 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GM2AP17900 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GM2AP17900 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GM2AP17900 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GM2AP17900 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GM2AP17900 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GM2AP17900 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GM2AP17900 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GM2AP17900 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GM2AP17900 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GM2AP17900 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GM2AP17900 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GM2AP17900 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GM2AP17900 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GM2AP17900 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GM2AP17900 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GM2AP17900 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GM2AP17900 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GM2AP17900 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GM2AP17900 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GM2AP17900 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GM2AP17900 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GM2AP17900 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GM2AP17900 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GM2AP17900 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GM2AP17900 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GM2AP17900 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GM2AP17900 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GM2AP17900 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GM2AP17900 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GM2AP17900 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GM2AP17900 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GM2AP17900 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GM2AP17900 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GM2AP17900 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GM2AP17900 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GM2AP17900 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GM2AP17900 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GM2AP17900 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GM2AP17900 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GM2AP17900 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GM2AP17900 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GM2AP17900 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GM2AP17900 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GM2AP17900 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GM2AP17900 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GM2AP17900 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GM2AP17900 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GM2AP17900 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GM2AP17900 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GM2AP17900 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GM2AP17900 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GM2AP17900 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GM2AP17900 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GM2AP17900 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GM2AP17900 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GM2AP17900 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GM2AP17900 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GM2AP17900 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GM2AP17900 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GM2AP17900 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GM2AP17900 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GM2AP17900 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GM2AP17900 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GM2AP17900 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GM2AP17900 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GM2AP17900 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GM2AP17900 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GM2AP17900 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GM2AP17900 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GM2AP17900 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GM2AP17900 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GM2AP17900 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GM2AP17900 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GM2AP17900 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GM2AP17900 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GM2AP17900 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GM2AP17900 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GM2AP17900 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GM2AP17900 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GM2AP17900 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms