Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCFC2P16383 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms