Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HLA-EP13747 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HLA-EP13747 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HLA-EP13747 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-EP13747 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-EP13747 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-EP13747 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-EP13747 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-EP13747 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms