Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT13P13646 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT13P13646 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT13P13646 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT13P13646 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT13P13646 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT13P13646 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT13P13646 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT13P13646 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT13P13646 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT13P13646 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT13P13646 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT13P13646 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT13P13646 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
KRT13P13646 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT13P13646 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT13P13646 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT13P13646 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT13P13646 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT13P13646 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT13P13646 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT13P13646 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT13P13646 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT13P13646 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT13P13646 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT13P13646 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT13P13646 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT13P13646 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT13P13646 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT13P13646 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT13P13646 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT13P13646 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT13P13646 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT13P13646 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT13P13646 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRT13P13646 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT13P13646 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT13P13646 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT13P13646 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT13P13646 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT13P13646 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT13P13646 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT13P13646 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT13P13646 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT13P13646 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT13P13646 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT13P13646 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT13P13646 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT13P13646 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT13P13646 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT13P13646 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT13P13646 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT13P13646 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT13P13646 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT13P13646 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT13P13646 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT13P13646 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT13P13646 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT13P13646 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT13P13646 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT13P13646 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT13P13646 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT13P13646 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT13P13646 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT13P13646 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT13P13646 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT13P13646 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT13P13646 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT13P13646 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT13P13646 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT13P13646 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT13P13646 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT13P13646 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT13P13646 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT13P13646 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT13P13646 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT13P13646 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT13P13646 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT13P13646 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT13P13646 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT13P13646 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT13P13646 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT13P13646 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT13P13646 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT13P13646 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT13P13646 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT13P13646 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT13P13646 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT13P13646 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT13P13646 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT13P13646 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT13P13646 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT13P13646 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT13P13646 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT13P13646 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT13P13646 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT13P13646 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT13P13646 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT13P13646 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT13P13646 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms