Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCANP13611 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCANP13611 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VCANP13611 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCANP13611 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCANP13611 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCANP13611 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCANP13611 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCANP13611 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCANP13611 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCANP13611 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VCANP13611 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCANP13611 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VCANP13611 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCANP13611 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCANP13611 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCANP13611 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCANP13611 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VCANP13611 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VCANP13611 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VCANP13611 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VCANP13611 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VCANP13611 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VCANP13611 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCANP13611 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCANP13611 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCANP13611 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCANP13611 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCANP13611 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCANP13611 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VCANP13611 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCANP13611 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCANP13611 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCANP13611 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCANP13611 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCANP13611 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCANP13611 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCANP13611 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VCANP13611 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCANP13611 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCANP13611 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCANP13611 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCANP13611 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCANP13611 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCANP13611 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCANP13611 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCANP13611 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCANP13611 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCANP13611 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCANP13611 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCANP13611 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCANP13611 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCANP13611 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCANP13611 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCANP13611 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCANP13611 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCANP13611 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCANP13611 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCANP13611 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VCANP13611 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCANP13611 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCANP13611 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCANP13611 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCANP13611 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCANP13611 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCANP13611 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCANP13611 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCANP13611 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCANP13611 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VCANP13611 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VCANP13611 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCANP13611 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VCANP13611 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCANP13611 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCANP13611 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VCANP13611 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCANP13611 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCANP13611 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCANP13611 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCANP13611 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCANP13611 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCANP13611 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCANP13611 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VCANP13611 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCANP13611 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCANP13611 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCANP13611 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCANP13611 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCANP13611 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCANP13611 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCANP13611 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCANP13611 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCANP13611 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCANP13611 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCANP13611 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCANP13611 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VCANP13611 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCANP13611 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VCANP13611 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCANP13611 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms