Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GP1BBP13224 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms