Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms