Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC37.32■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOP2AP11388 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC37.26■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms