Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CT47B1P0C2W7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms