Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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