Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOP08100 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOP08100 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOP08100 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOP08100 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOP08100 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOP08100 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOP08100 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOP08100 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOP08100 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOP08100 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOP08100 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOP08100 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOP08100 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOP08100 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOP08100 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOP08100 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOP08100 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOP08100 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOP08100 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOP08100 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOP08100 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOP08100 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOP08100 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOP08100 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOP08100 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOP08100 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOP08100 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOP08100 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOP08100 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOP08100 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOP08100 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOP08100 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOP08100 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOP08100 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOP08100 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOP08100 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOP08100 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOP08100 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOP08100 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOP08100 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOP08100 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOP08100 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOP08100 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOP08100 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOP08100 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOP08100 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOP08100 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOP08100 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOP08100 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOP08100 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOP08100 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOP08100 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOP08100 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOP08100 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOP08100 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOP08100 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOP08100 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOP08100 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOP08100 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOP08100 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOP08100 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOP08100 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOP08100 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOP08100 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOP08100 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOP08100 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOP08100 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOP08100 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOP08100 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOP08100 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOP08100 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOP08100 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOP08100 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOP08100 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOP08100 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOP08100 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOP08100 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOP08100 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOP08100 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOP08100 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOP08100 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOP08100 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOP08100 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOP08100 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOP08100 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOP08100 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOP08100 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOP08100 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOP08100 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOP08100 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOP08100 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOP08100 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOP08100 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOP08100 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOP08100 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOP08100 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOP08100 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOP08100 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOP08100 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms