Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms