Protein–RNA interactions for Protein: O94983

CAMTA2, Calmodulin-binding transcription activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA2O94983 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAMTA2O94983 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMTA2O94983 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms