Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEBLO76041 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEBLO76041 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NEBLO76041 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEBLO76041 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEBLO76041 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEBLO76041 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEBLO76041 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NEBLO76041 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEBLO76041 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEBLO76041 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEBLO76041 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEBLO76041 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEBLO76041 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEBLO76041 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEBLO76041 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEBLO76041 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEBLO76041 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEBLO76041 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEBLO76041 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEBLO76041 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEBLO76041 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEBLO76041 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEBLO76041 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEBLO76041 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEBLO76041 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEBLO76041 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEBLO76041 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEBLO76041 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEBLO76041 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEBLO76041 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEBLO76041 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEBLO76041 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEBLO76041 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEBLO76041 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEBLO76041 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEBLO76041 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEBLO76041 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEBLO76041 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEBLO76041 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEBLO76041 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEBLO76041 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEBLO76041 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEBLO76041 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEBLO76041 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEBLO76041 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEBLO76041 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEBLO76041 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEBLO76041 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEBLO76041 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NEBLO76041 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEBLO76041 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEBLO76041 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEBLO76041 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEBLO76041 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEBLO76041 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEBLO76041 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEBLO76041 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEBLO76041 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEBLO76041 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEBLO76041 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEBLO76041 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEBLO76041 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEBLO76041 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEBLO76041 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEBLO76041 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEBLO76041 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEBLO76041 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NEBLO76041 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEBLO76041 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEBLO76041 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEBLO76041 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEBLO76041 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEBLO76041 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEBLO76041 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEBLO76041 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEBLO76041 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEBLO76041 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEBLO76041 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEBLO76041 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEBLO76041 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEBLO76041 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEBLO76041 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NEBLO76041 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEBLO76041 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEBLO76041 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEBLO76041 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEBLO76041 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEBLO76041 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEBLO76041 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEBLO76041 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEBLO76041 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEBLO76041 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEBLO76041 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEBLO76041 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEBLO76041 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEBLO76041 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEBLO76041 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEBLO76041 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEBLO76041 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms