Protein–RNA interactions for Protein: O75678

RFPL2, Ret finger protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL2O75678 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFPL2O75678 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms