Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPM3O75607 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPM3O75607 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPM3O75607 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPM3O75607 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPM3O75607 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPM3O75607 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPM3O75607 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPM3O75607 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPM3O75607 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPM3O75607 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPM3O75607 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NPM3O75607 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPM3O75607 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPM3O75607 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPM3O75607 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPM3O75607 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPM3O75607 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPM3O75607 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPM3O75607 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPM3O75607 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPM3O75607 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NPM3O75607 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPM3O75607 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPM3O75607 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPM3O75607 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPM3O75607 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPM3O75607 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPM3O75607 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPM3O75607 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPM3O75607 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPM3O75607 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPM3O75607 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPM3O75607 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NPM3O75607 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPM3O75607 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPM3O75607 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPM3O75607 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPM3O75607 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPM3O75607 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPM3O75607 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPM3O75607 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPM3O75607 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NPM3O75607 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NPM3O75607 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPM3O75607 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPM3O75607 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPM3O75607 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPM3O75607 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NPM3O75607 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPM3O75607 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPM3O75607 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPM3O75607 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPM3O75607 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPM3O75607 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPM3O75607 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPM3O75607 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPM3O75607 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPM3O75607 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPM3O75607 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPM3O75607 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NPM3O75607 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPM3O75607 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPM3O75607 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPM3O75607 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPM3O75607 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPM3O75607 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NPM3O75607 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NPM3O75607 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NPM3O75607 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPM3O75607 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPM3O75607 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPM3O75607 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPM3O75607 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPM3O75607 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NPM3O75607 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPM3O75607 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NPM3O75607 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPM3O75607 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPM3O75607 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPM3O75607 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPM3O75607 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPM3O75607 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPM3O75607 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPM3O75607 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPM3O75607 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPM3O75607 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPM3O75607 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NPM3O75607 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPM3O75607 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPM3O75607 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPM3O75607 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NPM3O75607 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPM3O75607 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPM3O75607 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPM3O75607 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPM3O75607 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPM3O75607 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPM3O75607 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPM3O75607 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms