Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSDE1O75534 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms