Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF40O75150 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF40O75150 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF40O75150 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF40O75150 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF40O75150 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF40O75150 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF40O75150 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF40O75150 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF40O75150 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF40O75150 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF40O75150 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF40O75150 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF40O75150 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF40O75150 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF40O75150 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF40O75150 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF40O75150 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF40O75150 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF40O75150 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF40O75150 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF40O75150 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF40O75150 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF40O75150 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF40O75150 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF40O75150 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF40O75150 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF40O75150 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF40O75150 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF40O75150 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF40O75150 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF40O75150 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF40O75150 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF40O75150 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF40O75150 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF40O75150 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF40O75150 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF40O75150 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF40O75150 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF40O75150 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF40O75150 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF40O75150 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF40O75150 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF40O75150 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF40O75150 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF40O75150 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF40O75150 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF40O75150 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF40O75150 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF40O75150 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF40O75150 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF40O75150 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF40O75150 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF40O75150 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF40O75150 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF40O75150 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF40O75150 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF40O75150 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF40O75150 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF40O75150 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF40O75150 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF40O75150 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF40O75150 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF40O75150 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF40O75150 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF40O75150 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF40O75150 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF40O75150 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF40O75150 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF40O75150 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF40O75150 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF40O75150 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF40O75150 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF40O75150 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF40O75150 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF40O75150 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF40O75150 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF40O75150 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF40O75150 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF40O75150 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF40O75150 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF40O75150 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF40O75150 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF40O75150 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF40O75150 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF40O75150 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF40O75150 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF40O75150 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF40O75150 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF40O75150 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF40O75150 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF40O75150 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF40O75150 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF40O75150 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF40O75150 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF40O75150 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF40O75150 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF40O75150 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF40O75150 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF40O75150 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms