Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms