Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRNO43815 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRNO43815 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRNO43815 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRNO43815 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRNO43815 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
STRNO43815 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRNO43815 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STRNO43815 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRNO43815 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRNO43815 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STRNO43815 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRNO43815 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRNO43815 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24■■□□□ 1.43
STRNO43815 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24■■□□□ 1.43
STRNO43815 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STRNO43815 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STRNO43815 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STRNO43815 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
STRNO43815 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRNO43815 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STRNO43815 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STRNO43815 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRNO43815 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRNO43815 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRNO43815 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRNO43815 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRNO43815 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
STRNO43815 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRNO43815 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRNO43815 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRNO43815 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRNO43815 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRNO43815 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
STRNO43815 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRNO43815 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRNO43815 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
STRNO43815 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
STRNO43815 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRNO43815 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRNO43815 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRNO43815 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRNO43815 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRNO43815 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRNO43815 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRNO43815 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRNO43815 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRNO43815 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRNO43815 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRNO43815 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRNO43815 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRNO43815 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRNO43815 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRNO43815 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRNO43815 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRNO43815 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRNO43815 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
STRNO43815 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRNO43815 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
STRNO43815 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRNO43815 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRNO43815 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRNO43815 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
STRNO43815 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRNO43815 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRNO43815 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRNO43815 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRNO43815 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRNO43815 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRNO43815 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRNO43815 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRNO43815 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRNO43815 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRNO43815 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRNO43815 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRNO43815 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRNO43815 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRNO43815 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRNO43815 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRNO43815 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRNO43815 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRNO43815 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRNO43815 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
STRNO43815 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRNO43815 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRNO43815 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRNO43815 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRNO43815 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRNO43815 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
STRNO43815 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRNO43815 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRNO43815 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRNO43815 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRNO43815 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRNO43815 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRNO43815 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRNO43815 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRNO43815 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRNO43815 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRNO43815 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms