Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms