Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTLC1O15269 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTLC1O15269 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms