Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VGFO15240 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VGFO15240 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VGFO15240 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VGFO15240 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VGFO15240 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VGFO15240 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
VGFO15240 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VGFO15240 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VGFO15240 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VGFO15240 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VGFO15240 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VGFO15240 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VGFO15240 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VGFO15240 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VGFO15240 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VGFO15240 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
VGFO15240 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VGFO15240 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VGFO15240 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VGFO15240 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VGFO15240 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VGFO15240 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VGFO15240 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VGFO15240 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VGFO15240 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VGFO15240 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VGFO15240 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VGFO15240 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VGFO15240 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VGFO15240 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VGFO15240 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VGFO15240 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VGFO15240 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VGFO15240 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VGFO15240 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VGFO15240 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VGFO15240 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
VGFO15240 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
VGFO15240 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
VGFO15240 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
VGFO15240 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
VGFO15240 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
VGFO15240 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VGFO15240 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VGFO15240 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VGFO15240 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VGFO15240 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VGFO15240 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VGFO15240 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VGFO15240 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
VGFO15240 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VGFO15240 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
VGFO15240 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VGFO15240 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VGFO15240 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VGFO15240 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VGFO15240 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VGFO15240 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VGFO15240 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VGFO15240 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VGFO15240 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VGFO15240 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VGFO15240 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VGFO15240 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VGFO15240 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
VGFO15240 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
VGFO15240 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
VGFO15240 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
VGFO15240 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
VGFO15240 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
VGFO15240 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
VGFO15240 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
VGFO15240 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
VGFO15240 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
VGFO15240 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
VGFO15240 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VGFO15240 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VGFO15240 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VGFO15240 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VGFO15240 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VGFO15240 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VGFO15240 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VGFO15240 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VGFO15240 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
VGFO15240 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VGFO15240 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VGFO15240 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VGFO15240 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VGFO15240 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
VGFO15240 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
VGFO15240 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VGFO15240 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VGFO15240 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
VGFO15240 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
VGFO15240 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
VGFO15240 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VGFO15240 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC30■■■□□ 2.39
VGFO15240 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VGFO15240 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms