Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms