Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC80O14777 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC80O14777 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC80O14777 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC80O14777 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC80O14777 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC80O14777 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC80O14777 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC80O14777 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC80O14777 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC80O14777 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC80O14777 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC80O14777 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC80O14777 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC80O14777 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC80O14777 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC80O14777 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC80O14777 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC80O14777 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC80O14777 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC80O14777 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC80O14777 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC80O14777 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC80O14777 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC80O14777 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC80O14777 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC80O14777 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC80O14777 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC80O14777 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC80O14777 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC80O14777 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC80O14777 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC80O14777 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC80O14777 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC80O14777 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC80O14777 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDC80O14777 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDC80O14777 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDC80O14777 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDC80O14777 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDC80O14777 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDC80O14777 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDC80O14777 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDC80O14777 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDC80O14777 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDC80O14777 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDC80O14777 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDC80O14777 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDC80O14777 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NDC80O14777 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC80O14777 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC80O14777 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC80O14777 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC80O14777 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC80O14777 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC80O14777 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC80O14777 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC80O14777 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC80O14777 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC80O14777 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC80O14777 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC80O14777 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC80O14777 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC80O14777 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC80O14777 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC80O14777 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC80O14777 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC80O14777 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC80O14777 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC80O14777 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC80O14777 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC80O14777 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC80O14777 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC80O14777 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC80O14777 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC80O14777 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC80O14777 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC80O14777 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC80O14777 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC80O14777 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC80O14777 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC80O14777 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC80O14777 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC80O14777 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC80O14777 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC80O14777 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC80O14777 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC80O14777 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC80O14777 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC80O14777 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC80O14777 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC80O14777 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDC80O14777 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDC80O14777 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDC80O14777 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDC80O14777 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDC80O14777 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDC80O14777 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDC80O14777 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDC80O14777 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms