Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PODXLO00592 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PODXLO00592 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PODXLO00592 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PODXLO00592 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PODXLO00592 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PODXLO00592 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PODXLO00592 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PODXLO00592 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PODXLO00592 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PODXLO00592 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PODXLO00592 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PODXLO00592 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PODXLO00592 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PODXLO00592 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PODXLO00592 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PODXLO00592 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PODXLO00592 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PODXLO00592 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PODXLO00592 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PODXLO00592 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PODXLO00592 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PODXLO00592 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PODXLO00592 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PODXLO00592 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PODXLO00592 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PODXLO00592 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PODXLO00592 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PODXLO00592 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PODXLO00592 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PODXLO00592 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PODXLO00592 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PODXLO00592 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PODXLO00592 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PODXLO00592 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PODXLO00592 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PODXLO00592 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PODXLO00592 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PODXLO00592 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PODXLO00592 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PODXLO00592 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PODXLO00592 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PODXLO00592 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PODXLO00592 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PODXLO00592 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PODXLO00592 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PODXLO00592 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PODXLO00592 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXLO00592 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXLO00592 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXLO00592 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXLO00592 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXLO00592 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXLO00592 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXLO00592 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXLO00592 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXLO00592 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXLO00592 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXLO00592 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXLO00592 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXLO00592 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXLO00592 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXLO00592 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXLO00592 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PODXLO00592 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXLO00592 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXLO00592 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXLO00592 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXLO00592 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXLO00592 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXLO00592 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXLO00592 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXLO00592 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXLO00592 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXLO00592 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXLO00592 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXLO00592 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXLO00592 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXLO00592 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXLO00592 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXLO00592 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PODXLO00592 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXLO00592 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXLO00592 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXLO00592 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXLO00592 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXLO00592 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXLO00592 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXLO00592 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXLO00592 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXLO00592 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXLO00592 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXLO00592 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXLO00592 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXLO00592 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXLO00592 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXLO00592 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXLO00592 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXLO00592 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PODXLO00592 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms