Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3QKU1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3QKU1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
J3QKU1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
J3QKU1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3QKU1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3QKU1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3QKU1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3QKU1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3QKU1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3QKU1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3QKU1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3QKU1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3QKU1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3QKU1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3QKU1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3QKU1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3QKU1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3QKU1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3QKU1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3QKU1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3QKU1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3QKU1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3QKU1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
J3QKU1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
J3QKU1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3QKU1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3QKU1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3QKU1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
J3QKU1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
J3QKU1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3QKU1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
J3QKU1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
J3QKU1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
J3QKU1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
J3QKU1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
J3QKU1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3QKU1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3QKU1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3QKU1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3QKU1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3QKU1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3QKU1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
J3QKU1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3QKU1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3QKU1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3QKU1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3QKU1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3QKU1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3QKU1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3QKU1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3QKU1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3QKU1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3QKU1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3QKU1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QKU1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QKU1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QKU1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QKU1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QKU1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QKU1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QKU1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QKU1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QKU1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QKU1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QKU1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QKU1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QKU1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QKU1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QKU1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QKU1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QKU1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QKU1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QKU1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QKU1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QKU1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QKU1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QKU1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QKU1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QKU1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QKU1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QKU1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QKU1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QKU1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3QKU1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QKU1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QKU1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QKU1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QKU1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QKU1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QKU1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QKU1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QKU1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QKU1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QKU1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QKU1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QKU1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QKU1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QKU1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QKU1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms