Protein–RNA interactions for Protein: H3BMG3

SMKR1, Small lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1H3BMG3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms