Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRDCB7Z8K6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRDCB7Z8K6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms