Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms