Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms