Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NNZ2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NNZ2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NNZ2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NNZ2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NNZ2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NNZ2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NNZ2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NNZ2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NNZ2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NNZ2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NNZ2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NNZ2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NNZ2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NNZ2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NNZ2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NNZ2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NNZ2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NNZ2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NNZ2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NNZ2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A6NNZ2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A6NNZ2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A6NNZ2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NNZ2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NNZ2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NNZ2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NNZ2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NNZ2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NNZ2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NNZ2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NNZ2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NNZ2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NNZ2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NNZ2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NNZ2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NNZ2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NNZ2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NNZ2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NNZ2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NNZ2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NNZ2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NNZ2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NNZ2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NNZ2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NNZ2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NNZ2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NNZ2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NNZ2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NNZ2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NNZ2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NNZ2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NNZ2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NNZ2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NNZ2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NNZ2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NNZ2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NNZ2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NNZ2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NNZ2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NNZ2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NNZ2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NNZ2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NNZ2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A6NNZ2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A6NNZ2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A6NNZ2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A6NNZ2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A6NNZ2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A6NNZ2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A6NNZ2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A6NNZ2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NNZ2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NNZ2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NNZ2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NNZ2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NNZ2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NNZ2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NNZ2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NNZ2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NNZ2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NNZ2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NNZ2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NNZ2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NNZ2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NNZ2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NNZ2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NNZ2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NNZ2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NNZ2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NNZ2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NNZ2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NNZ2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NNZ2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NNZ2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NNZ2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NNZ2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NNZ2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NNZ2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NNZ2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms