Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms