Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCP1A6NGW2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms