Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L9A6NEM1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms